Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP10P09238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP10P09238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
MMP10P09238 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MMP10P09238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MMP10P09238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MMP10P09238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MMP10P09238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MMP10P09238 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MMP10P09238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MMP10P09238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MMP10P09238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MMP10P09238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MMP10P09238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MMP10P09238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MMP10P09238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MMP10P09238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MMP10P09238 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MMP10P09238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MMP10P09238 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP10P09238 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP10P09238 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP10P09238 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MMP10P09238 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MMP10P09238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MMP10P09238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MMP10P09238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MMP10P09238 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MMP10P09238 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MMP10P09238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MMP10P09238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MMP10P09238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MMP10P09238 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MMP10P09238 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MMP10P09238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MMP10P09238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MMP10P09238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MMP10P09238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MMP10P09238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MMP10P09238 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MMP10P09238 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MMP10P09238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
MMP10P09238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MMP10P09238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MMP10P09238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MMP10P09238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MMP10P09238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MMP10P09238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MMP10P09238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MMP10P09238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MMP10P09238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MMP10P09238 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MMP10P09238 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MMP10P09238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MMP10P09238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MMP10P09238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MMP10P09238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MMP10P09238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MMP10P09238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MMP10P09238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MMP10P09238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MMP10P09238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MMP10P09238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MMP10P09238 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MMP10P09238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MMP10P09238 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MMP10P09238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MMP10P09238 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MMP10P09238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MMP10P09238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
MMP10P09238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MMP10P09238 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MMP10P09238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MMP10P09238 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MMP10P09238 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MMP10P09238 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MMP10P09238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
MMP10P09238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MMP10P09238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
MMP10P09238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MMP10P09238 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MMP10P09238 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MMP10P09238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MMP10P09238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MMP10P09238 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MMP10P09238 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms