Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM2P08172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM2P08172 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM2P08172 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM2P08172 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM2P08172 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms