Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA6P05013 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA6P05013 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA6P05013 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA6P05013 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA6P05013 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms