Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN1LWP04000 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN1LWP04000 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1LWP04000 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN1LWP04000 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1LWP04000 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms