Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHG1P01857 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHG1P01857 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHG1P01857 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHG1P01857 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHG1P01857 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms