Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHEP01854 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHEP01854 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHEP01854 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHEP01854 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHEP01854 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHEP01854 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHEP01854 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHEP01854 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHEP01854 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHEP01854 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHEP01854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHEP01854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHEP01854 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHEP01854 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHEP01854 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IGHEP01854 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHEP01854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHEP01854 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHEP01854 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHEP01854 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHEP01854 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHEP01854 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHEP01854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHEP01854 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHEP01854 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHEP01854 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHEP01854 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHEP01854 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHEP01854 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHEP01854 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHEP01854 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHEP01854 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHEP01854 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHEP01854 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHEP01854 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHEP01854 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHEP01854 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHEP01854 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHEP01854 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHEP01854 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHEP01854 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHEP01854 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHEP01854 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHEP01854 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHEP01854 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHEP01854 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHEP01854 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHEP01854 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHEP01854 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHEP01854 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHEP01854 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHEP01854 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHEP01854 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHEP01854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHEP01854 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHEP01854 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHEP01854 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHEP01854 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHEP01854 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHEP01854 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGHEP01854 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGHEP01854 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHEP01854 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHEP01854 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHEP01854 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGHEP01854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGHEP01854 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGHEP01854 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHEP01854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHEP01854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHEP01854 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHEP01854 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHEP01854 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHEP01854 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHEP01854 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHEP01854 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHEP01854 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHEP01854 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHEP01854 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHEP01854 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHEP01854 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHEP01854 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHEP01854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHEP01854 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHEP01854 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHEP01854 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHEP01854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHEP01854 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHEP01854 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHEP01854 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHEP01854 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHEP01854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms