Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-39P01597 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-39P01597 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-39P01597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-39P01597 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-39P01597 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms