Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IL1AP01583 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IL1AP01583 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IL1AP01583 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IL1AP01583 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IL1AP01583 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IL1AP01583 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL1AP01583 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IL1AP01583 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IL1AP01583 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL1AP01583 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL1AP01583 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL1AP01583 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1AP01583 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1AP01583 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1AP01583 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL1AP01583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL1AP01583 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL1AP01583 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1AP01583 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1AP01583 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1AP01583 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1AP01583 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1AP01583 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1AP01583 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IL1AP01583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1AP01583 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1AP01583 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1AP01583 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1AP01583 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1AP01583 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1AP01583 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1AP01583 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1AP01583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL1AP01583 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL1AP01583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1AP01583 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1AP01583 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1AP01583 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1AP01583 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1AP01583 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1AP01583 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1AP01583 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IL1AP01583 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1AP01583 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1AP01583 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1AP01583 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1AP01583 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1AP01583 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1AP01583 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1AP01583 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1AP01583 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1AP01583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1AP01583 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL1AP01583 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IL1AP01583 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1AP01583 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1AP01583 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1AP01583 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL1AP01583 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL1AP01583 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL1AP01583 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1AP01583 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1AP01583 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1AP01583 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1AP01583 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1AP01583 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1AP01583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1AP01583 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL1AP01583 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL1AP01583 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL1AP01583 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL1AP01583 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL1AP01583 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL1AP01583 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL1AP01583 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL1AP01583 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL1AP01583 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL1AP01583 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL1AP01583 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL1AP01583 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL1AP01583 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IL1AP01583 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IL1AP01583 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IL1AP01583 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL1AP01583 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL1AP01583 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL1AP01583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL1AP01583 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL1AP01583 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL1AP01583 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL1AP01583 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL1AP01583 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL1AP01583 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL1AP01583 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms