Protein–RNA interactions for Protein: P01135

TGFA, Protransforming growth factor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFAP01135 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFAP01135 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFAP01135 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFAP01135 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFAP01135 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFAP01135 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFAP01135 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFAP01135 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFAP01135 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFAP01135 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFAP01135 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFAP01135 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFAP01135 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFAP01135 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFAP01135 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFAP01135 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGFAP01135 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFAP01135 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFAP01135 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFAP01135 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFAP01135 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFAP01135 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFAP01135 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFAP01135 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFAP01135 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFAP01135 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFAP01135 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFAP01135 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGFAP01135 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFAP01135 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFAP01135 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFAP01135 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFAP01135 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFAP01135 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFAP01135 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFAP01135 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFAP01135 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFAP01135 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFAP01135 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFAP01135 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFAP01135 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFAP01135 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFAP01135 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFAP01135 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFAP01135 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFAP01135 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFAP01135 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFAP01135 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFAP01135 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFAP01135 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFAP01135 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFAP01135 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFAP01135 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFAP01135 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFAP01135 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFAP01135 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFAP01135 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFAP01135 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFAP01135 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFAP01135 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFAP01135 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFAP01135 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFAP01135 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFAP01135 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFAP01135 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFAP01135 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFAP01135 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFAP01135 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFAP01135 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFAP01135 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFAP01135 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFAP01135 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFAP01135 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFAP01135 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFAP01135 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms