Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTAP01040 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTAP01040 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTAP01040 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTAP01040 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTAP01040 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTAP01040 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTAP01040 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSTAP01040 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTAP01040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTAP01040 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTAP01040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTAP01040 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTAP01040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTAP01040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTAP01040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTAP01040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTAP01040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSTAP01040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTAP01040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTAP01040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTAP01040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTAP01040 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTAP01040 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTAP01040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTAP01040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTAP01040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTAP01040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTAP01040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTAP01040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTAP01040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTAP01040 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTAP01040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTAP01040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTAP01040 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTAP01040 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTAP01040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSTAP01040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTAP01040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTAP01040 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTAP01040 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTAP01040 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTAP01040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTAP01040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTAP01040 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTAP01040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTAP01040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTAP01040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTAP01040 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTAP01040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTAP01040 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTAP01040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTAP01040 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTAP01040 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTAP01040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTAP01040 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTAP01040 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTAP01040 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTAP01040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTAP01040 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTAP01040 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTAP01040 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTAP01040 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTAP01040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTAP01040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTAP01040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTAP01040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTAP01040 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTAP01040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTAP01040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTAP01040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTAP01040 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTAP01040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTAP01040 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTAP01040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTAP01040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTAP01040 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTAP01040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTAP01040 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTAP01040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTAP01040 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTAP01040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTAP01040 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTAP01040 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTAP01040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTAP01040 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTAP01040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTAP01040 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTAP01040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTAP01040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTAP01040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTAP01040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTAP01040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTAP01040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTAP01040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms