Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPRP00739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPRP00739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPRP00739 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPRP00739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPRP00739 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPRP00739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPRP00739 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPRP00739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPRP00739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPRP00739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPRP00739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPRP00739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPRP00739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPRP00739 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPRP00739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPRP00739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPRP00739 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPRP00739 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPRP00739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPRP00739 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPRP00739 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPRP00739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPRP00739 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HPRP00739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPRP00739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPRP00739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPRP00739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPRP00739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPRP00739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPRP00739 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPRP00739 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPRP00739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPRP00739 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPRP00739 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPRP00739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPRP00739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPRP00739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPRP00739 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPRP00739 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.5 ms