Protein–RNA interactions for Protein: P00439

PAH, Phenylalanine-4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAHP00439 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAHP00439 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAHP00439 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAHP00439 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAHP00439 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAHP00439 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAHP00439 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAHP00439 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAHP00439 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAHP00439 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAHP00439 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAHP00439 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAHP00439 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAHP00439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAHP00439 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAHP00439 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAHP00439 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAHP00439 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAHP00439 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAHP00439 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAHP00439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAHP00439 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAHP00439 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAHP00439 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAHP00439 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAHP00439 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAHP00439 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAHP00439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAHP00439 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAHP00439 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAHP00439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAHP00439 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAHP00439 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAHP00439 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAHP00439 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAHP00439 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAHP00439 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAHP00439 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAHP00439 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAHP00439 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAHP00439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAHP00439 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAHP00439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAHP00439 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAHP00439 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAHP00439 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAHP00439 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAHP00439 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAHP00439 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAHP00439 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAHP00439 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAHP00439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAHP00439 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAHP00439 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAHP00439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAHP00439 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAHP00439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAHP00439 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAHP00439 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAHP00439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAHP00439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAHP00439 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAHP00439 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAHP00439 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAHP00439 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAHP00439 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAHP00439 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAHP00439 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAHP00439 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAHP00439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAHP00439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAHP00439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAHP00439 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAHP00439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAHP00439 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAHP00439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAHP00439 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAHP00439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAHP00439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAHP00439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAHP00439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAHP00439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAHP00439 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAHP00439 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAHP00439 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms