Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
POLR1AO95602 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
POLR1AO95602 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
POLR1AO95602 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
POLR1AO95602 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
POLR1AO95602 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
POLR1AO95602 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
POLR1AO95602 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
POLR1AO95602 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
POLR1AO95602 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.82
POLR1AO95602 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms