Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN9O95484 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN9O95484 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN9O95484 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN9O95484 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN9O95484 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN9O95484 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN9O95484 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN9O95484 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN9O95484 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms