Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX4O95219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX4O95219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX4O95219 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX4O95219 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX4O95219 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX4O95219 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX4O95219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX4O95219 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX4O95219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX4O95219 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX4O95219 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX4O95219 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX4O95219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX4O95219 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX4O95219 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX4O95219 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX4O95219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX4O95219 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX4O95219 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX4O95219 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX4O95219 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX4O95219 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX4O95219 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX4O95219 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX4O95219 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX4O95219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX4O95219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX4O95219 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX4O95219 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX4O95219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX4O95219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX4O95219 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX4O95219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX4O95219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX4O95219 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX4O95219 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX4O95219 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX4O95219 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX4O95219 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX4O95219 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX4O95219 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX4O95219 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX4O95219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX4O95219 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX4O95219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX4O95219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX4O95219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX4O95219 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX4O95219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX4O95219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX4O95219 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX4O95219 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX4O95219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX4O95219 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX4O95219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX4O95219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX4O95219 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX4O95219 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX4O95219 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX4O95219 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX4O95219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX4O95219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX4O95219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX4O95219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX4O95219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX4O95219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX4O95219 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX4O95219 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX4O95219 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX4O95219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX4O95219 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX4O95219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX4O95219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX4O95219 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX4O95219 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX4O95219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX4O95219 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX4O95219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX4O95219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX4O95219 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX4O95219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX4O95219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX4O95219 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX4O95219 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX4O95219 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX4O95219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX4O95219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms