Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDRT1O95170 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT1O95170 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDRT1O95170 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDRT1O95170 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT1O95170 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.3 ms