Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAF4O95104 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAF4O95104 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAF4O95104 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAF4O95104 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAF4O95104 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAF4O95104 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAF4O95104 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAF4O95104 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAF4O95104 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAF4O95104 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAF4O95104 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAF4O95104 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAF4O95104 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAF4O95104 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAF4O95104 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAF4O95104 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAF4O95104 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAF4O95104 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAF4O95104 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAF4O95104 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAF4O95104 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAF4O95104 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms