Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN1O94985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSTN1O94985 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN1O94985 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN1O94985 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSTN1O94985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSTN1O94985 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms