Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEA3O75764 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEA3O75764 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCEA3O75764 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEA3O75764 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCEA3O75764 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCEA3O75764 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCEA3O75764 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCEA3O75764 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCEA3O75764 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCEA3O75764 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms