Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
JRKO75564 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
JRKO75564 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
JRKO75564 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
JRKO75564 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
JRKO75564 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
JRKO75564 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
JRKO75564 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
JRKO75564 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
JRKO75564 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
JRKO75564 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
JRKO75564 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
JRKO75564 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
JRKO75564 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
JRKO75564 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
JRKO75564 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
JRKO75564 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
JRKO75564 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
JRKO75564 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
JRKO75564 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
JRKO75564 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
JRKO75564 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
JRKO75564 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
JRKO75564 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
JRKO75564 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
JRKO75564 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
JRKO75564 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
JRKO75564 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
JRKO75564 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
JRKO75564 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
JRKO75564 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
JRKO75564 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
JRKO75564 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
JRKO75564 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
JRKO75564 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
JRKO75564 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
JRKO75564 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
JRKO75564 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
JRKO75564 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
JRKO75564 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
JRKO75564 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
JRKO75564 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
JRKO75564 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
JRKO75564 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
JRKO75564 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
JRKO75564 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
JRKO75564 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JRKO75564 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JRKO75564 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
JRKO75564 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
JRKO75564 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
JRKO75564 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
JRKO75564 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
JRKO75564 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
JRKO75564 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
JRKO75564 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
JRKO75564 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
JRKO75564 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
JRKO75564 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
JRKO75564 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
JRKO75564 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
JRKO75564 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JRKO75564 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
JRKO75564 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
JRKO75564 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JRKO75564 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
JRKO75564 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JRKO75564 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JRKO75564 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
JRKO75564 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JRKO75564 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
JRKO75564 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
JRKO75564 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JRKO75564 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JRKO75564 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JRKO75564 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JRKO75564 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JRKO75564 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JRKO75564 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JRKO75564 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JRKO75564 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JRKO75564 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JRKO75564 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JRKO75564 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JRKO75564 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms