Protein–RNA interactions for Protein: O75420

GIGYF1, GRB10-interacting GYF protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIGYF1O75420 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GIGYF1O75420 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GIGYF1O75420 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GIGYF1O75420 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GIGYF1O75420 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GIGYF1O75420 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GIGYF1O75420 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GIGYF1O75420 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GIGYF1O75420 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GIGYF1O75420 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms