Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD6O75340 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD6O75340 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD6O75340 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6O75340 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD6O75340 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD6O75340 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD6O75340 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms