Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIA3O75145 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIA3O75145 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIA3O75145 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPFIA3O75145 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIA3O75145 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PPFIA3O75145 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPFIA3O75145 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPFIA3O75145 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA3O75145 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPFIA3O75145 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms