Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNSO60931 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNSO60931 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNSO60931 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNSO60931 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNSO60931 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNSO60931 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNSO60931 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNSO60931 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNSO60931 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNSO60931 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNSO60931 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNSO60931 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNSO60931 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNSO60931 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNSO60931 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNSO60931 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNSO60931 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNSO60931 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNSO60931 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNSO60931 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNSO60931 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNSO60931 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNSO60931 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNSO60931 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNSO60931 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNSO60931 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNSO60931 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNSO60931 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNSO60931 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNSO60931 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNSO60931 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNSO60931 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNSO60931 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNSO60931 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNSO60931 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNSO60931 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNSO60931 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNSO60931 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNSO60931 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNSO60931 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNSO60931 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNSO60931 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNSO60931 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNSO60931 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNSO60931 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNSO60931 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNSO60931 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNSO60931 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNSO60931 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNSO60931 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNSO60931 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNSO60931 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNSO60931 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNSO60931 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNSO60931 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNSO60931 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNSO60931 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNSO60931 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNSO60931 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNSO60931 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNSO60931 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNSO60931 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNSO60931 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNSO60931 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNSO60931 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNSO60931 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNSO60931 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNSO60931 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNSO60931 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNSO60931 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNSO60931 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNSO60931 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNSO60931 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNSO60931 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNSO60931 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNSO60931 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNSO60931 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNSO60931 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNSO60931 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNSO60931 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNSO60931 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNSO60931 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNSO60931 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNSO60931 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNSO60931 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNSO60931 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms