Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CACNA1FO60840 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CACNA1FO60840 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CACNA1FO60840 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1FO60840 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CACNA1FO60840 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CACNA1FO60840 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CACNA1FO60840 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNA1FO60840 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CACNA1FO60840 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CACNA1FO60840 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CACNA1FO60840 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CACNA1FO60840 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CACNA1FO60840 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CACNA1FO60840 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CACNA1FO60840 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CACNA1FO60840 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CACNA1FO60840 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CACNA1FO60840 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CACNA1FO60840 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CACNA1FO60840 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CACNA1FO60840 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms