Protein–RNA interactions for Protein: O60831

PRAF2, PRA1 family protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAF2O60831 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAF2O60831 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAF2O60831 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAF2O60831 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAF2O60831 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAF2O60831 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms