Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A2O60779 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A2O60779 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC19A2O60779 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A2O60779 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC19A2O60779 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms