Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX3O60493 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX3O60493 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX3O60493 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX3O60493 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX3O60493 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX3O60493 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX3O60493 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX3O60493 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX3O60493 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX3O60493 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX3O60493 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX3O60493 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX3O60493 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX3O60493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX3O60493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX3O60493 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX3O60493 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX3O60493 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX3O60493 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX3O60493 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX3O60493 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX3O60493 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX3O60493 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX3O60493 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX3O60493 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX3O60493 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX3O60493 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX3O60493 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX3O60493 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX3O60493 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX3O60493 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX3O60493 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX3O60493 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX3O60493 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX3O60493 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX3O60493 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX3O60493 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX3O60493 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX3O60493 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX3O60493 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX3O60493 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX3O60493 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX3O60493 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX3O60493 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX3O60493 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX3O60493 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX3O60493 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX3O60493 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX3O60493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX3O60493 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX3O60493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX3O60493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX3O60493 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX3O60493 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX3O60493 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX3O60493 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX3O60493 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX3O60493 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX3O60493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX3O60493 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX3O60493 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX3O60493 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX3O60493 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX3O60493 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX3O60493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX3O60493 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX3O60493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX3O60493 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX3O60493 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX3O60493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX3O60493 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX3O60493 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX3O60493 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX3O60493 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX3O60493 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX3O60493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX3O60493 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX3O60493 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX3O60493 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX3O60493 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX3O60493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX3O60493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX3O60493 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX3O60493 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX3O60493 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX3O60493 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX3O60493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX3O60493 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX3O60493 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX3O60493 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX3O60493 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX3O60493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX3O60493 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms