Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH7O60245 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH7O60245 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH7O60245 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDH7O60245 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH7O60245 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH7O60245 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms