Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIREO43918 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIREO43918 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIREO43918 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIREO43918 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIREO43918 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIREO43918 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIREO43918 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIREO43918 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIREO43918 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIREO43918 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIREO43918 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIREO43918 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIREO43918 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIREO43918 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIREO43918 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIREO43918 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIREO43918 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIREO43918 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIREO43918 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIREO43918 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIREO43918 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AIREO43918 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIREO43918 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIREO43918 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIREO43918 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIREO43918 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIREO43918 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIREO43918 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIREO43918 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIREO43918 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIREO43918 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIREO43918 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIREO43918 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIREO43918 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AIREO43918 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIREO43918 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIREO43918 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AIREO43918 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIREO43918 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIREO43918 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIREO43918 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIREO43918 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIREO43918 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIREO43918 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AIREO43918 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIREO43918 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIREO43918 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIREO43918 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIREO43918 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIREO43918 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIREO43918 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIREO43918 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIREO43918 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIREO43918 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIREO43918 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIREO43918 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIREO43918 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIREO43918 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIREO43918 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIREO43918 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIREO43918 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIREO43918 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIREO43918 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIREO43918 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIREO43918 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIREO43918 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIREO43918 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIREO43918 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIREO43918 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AIREO43918 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AIREO43918 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIREO43918 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIREO43918 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIREO43918 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIREO43918 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIREO43918 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIREO43918 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIREO43918 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AIREO43918 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIREO43918 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIREO43918 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIREO43918 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIREO43918 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIREO43918 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIREO43918 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIREO43918 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIREO43918 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIREO43918 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AIREO43918 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIREO43918 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIREO43918 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIREO43918 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIREO43918 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIREO43918 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms