Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP9O43818 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP9O43818 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP9O43818 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP9O43818 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP9O43818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP9O43818 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RRP9O43818 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP9O43818 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP9O43818 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RRP9O43818 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP9O43818 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP9O43818 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP9O43818 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP9O43818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP9O43818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP9O43818 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP9O43818 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP9O43818 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP9O43818 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP9O43818 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP9O43818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP9O43818 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP9O43818 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP9O43818 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP9O43818 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP9O43818 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP9O43818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP9O43818 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP9O43818 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP9O43818 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP9O43818 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP9O43818 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP9O43818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP9O43818 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP9O43818 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP9O43818 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP9O43818 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP9O43818 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP9O43818 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP9O43818 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP9O43818 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP9O43818 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP9O43818 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP9O43818 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP9O43818 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP9O43818 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP9O43818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP9O43818 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP9O43818 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP9O43818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP9O43818 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP9O43818 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP9O43818 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP9O43818 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP9O43818 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP9O43818 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP9O43818 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP9O43818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP9O43818 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP9O43818 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP9O43818 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP9O43818 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP9O43818 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP9O43818 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP9O43818 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP9O43818 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP9O43818 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP9O43818 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP9O43818 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP9O43818 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP9O43818 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP9O43818 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP9O43818 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP9O43818 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP9O43818 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP9O43818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP9O43818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP9O43818 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP9O43818 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP9O43818 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP9O43818 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP9O43818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP9O43818 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP9O43818 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP9O43818 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP9O43818 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP9O43818 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP9O43818 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP9O43818 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms