Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP1G1O43747 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP1G1O43747 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP1G1O43747 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP1G1O43747 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP1G1O43747 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP1G1O43747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms