Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP2O43745 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP2O43745 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP2O43745 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP2O43745 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP2O43745 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP2O43745 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP2O43745 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP2O43745 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP2O43745 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP2O43745 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP2O43745 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP2O43745 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP2O43745 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHP2O43745 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHP2O43745 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHP2O43745 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHP2O43745 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHP2O43745 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHP2O43745 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHP2O43745 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms