Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIMM44O43615 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TIMM44O43615 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIMM44O43615 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TIMM44O43615 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TIMM44O43615 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIMM44O43615 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIMM44O43615 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIMM44O43615 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIMM44O43615 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TIMM44O43615 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TIMM44O43615 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMM44O43615 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIMM44O43615 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIMM44O43615 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMM44O43615 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMM44O43615 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms