Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT7O43581 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT7O43581 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT7O43581 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT7O43581 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT7O43581 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT7O43581 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT7O43581 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT7O43581 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT7O43581 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT7O43581 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT7O43581 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT7O43581 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT7O43581 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT7O43581 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT7O43581 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT7O43581 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT7O43581 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT7O43581 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT7O43581 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT7O43581 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT7O43581 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT7O43581 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT7O43581 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT7O43581 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT7O43581 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT7O43581 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT7O43581 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT7O43581 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT7O43581 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT7O43581 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT7O43581 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT7O43581 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT7O43581 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT7O43581 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT7O43581 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT7O43581 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT7O43581 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT7O43581 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT7O43581 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT7O43581 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT7O43581 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT7O43581 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT7O43581 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT7O43581 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT7O43581 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT7O43581 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT7O43581 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT7O43581 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT7O43581 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT7O43581 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT7O43581 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT7O43581 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT7O43581 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT7O43581 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT7O43581 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT7O43581 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT7O43581 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT7O43581 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT7O43581 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT7O43581 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT7O43581 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT7O43581 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT7O43581 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT7O43581 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT7O43581 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT7O43581 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT7O43581 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT7O43581 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT7O43581 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT7O43581 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT7O43581 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT7O43581 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT7O43581 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT7O43581 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT7O43581 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT7O43581 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT7O43581 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT7O43581 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT7O43581 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT7O43581 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT7O43581 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT7O43581 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT7O43581 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT7O43581 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT7O43581 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT7O43581 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT7O43581 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT7O43581 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms