Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
EPB41L2O43491 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EPB41L2O43491 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EPB41L2O43491 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EPB41L2O43491 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EPB41L2O43491 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
EPB41L2O43491 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
EPB41L2O43491 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EPB41L2O43491 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms