Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNAB3O43448 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNAB3O43448 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNAB3O43448 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNAB3O43448 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms