Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERI3O43414 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERI3O43414 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERI3O43414 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERI3O43414 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERI3O43414 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERI3O43414 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERI3O43414 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERI3O43414 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERI3O43414 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERI3O43414 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERI3O43414 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERI3O43414 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERI3O43414 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERI3O43414 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERI3O43414 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERI3O43414 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERI3O43414 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERI3O43414 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERI3O43414 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERI3O43414 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERI3O43414 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERI3O43414 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERI3O43414 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERI3O43414 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERI3O43414 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERI3O43414 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERI3O43414 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERI3O43414 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERI3O43414 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERI3O43414 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERI3O43414 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERI3O43414 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERI3O43414 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERI3O43414 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERI3O43414 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERI3O43414 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERI3O43414 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERI3O43414 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERI3O43414 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERI3O43414 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERI3O43414 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERI3O43414 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERI3O43414 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERI3O43414 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERI3O43414 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERI3O43414 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERI3O43414 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERI3O43414 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERI3O43414 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERI3O43414 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERI3O43414 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERI3O43414 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERI3O43414 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERI3O43414 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERI3O43414 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERI3O43414 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERI3O43414 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERI3O43414 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERI3O43414 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERI3O43414 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERI3O43414 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERI3O43414 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERI3O43414 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERI3O43414 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERI3O43414 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERI3O43414 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERI3O43414 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERI3O43414 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERI3O43414 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERI3O43414 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERI3O43414 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERI3O43414 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERI3O43414 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERI3O43414 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERI3O43414 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERI3O43414 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERI3O43414 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERI3O43414 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERI3O43414 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERI3O43414 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERI3O43414 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERI3O43414 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERI3O43414 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERI3O43414 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERI3O43414 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERI3O43414 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERI3O43414 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERI3O43414 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERI3O43414 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERI3O43414 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERI3O43414 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERI3O43414 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERI3O43414 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERI3O43414 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms