Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSI1O43347 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSI1O43347 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSI1O43347 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSI1O43347 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSI1O43347 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSI1O43347 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSI1O43347 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MSI1O43347 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSI1O43347 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSI1O43347 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSI1O43347 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSI1O43347 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSI1O43347 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MSI1O43347 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSI1O43347 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSI1O43347 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSI1O43347 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSI1O43347 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSI1O43347 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSI1O43347 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSI1O43347 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSI1O43347 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSI1O43347 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSI1O43347 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSI1O43347 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSI1O43347 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSI1O43347 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSI1O43347 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSI1O43347 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSI1O43347 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSI1O43347 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSI1O43347 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSI1O43347 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSI1O43347 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSI1O43347 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSI1O43347 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSI1O43347 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSI1O43347 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSI1O43347 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSI1O43347 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSI1O43347 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSI1O43347 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSI1O43347 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSI1O43347 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSI1O43347 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSI1O43347 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSI1O43347 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSI1O43347 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSI1O43347 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSI1O43347 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSI1O43347 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSI1O43347 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSI1O43347 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSI1O43347 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSI1O43347 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSI1O43347 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSI1O43347 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSI1O43347 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSI1O43347 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSI1O43347 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSI1O43347 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSI1O43347 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSI1O43347 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSI1O43347 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSI1O43347 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSI1O43347 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSI1O43347 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSI1O43347 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSI1O43347 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSI1O43347 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSI1O43347 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSI1O43347 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSI1O43347 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSI1O43347 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSI1O43347 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MSI1O43347 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSI1O43347 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MSI1O43347 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSI1O43347 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSI1O43347 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSI1O43347 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSI1O43347 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSI1O43347 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSI1O43347 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSI1O43347 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSI1O43347 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSI1O43347 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSI1O43347 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSI1O43347 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSI1O43347 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSI1O43347 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSI1O43347 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSI1O43347 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MSI1O43347 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSI1O43347 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSI1O43347 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSI1O43347 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSI1O43347 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSI1O43347 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms