Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF1O43189 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF1O43189 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF1O43189 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF1O43189 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF1O43189 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF1O43189 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF1O43189 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF1O43189 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF1O43189 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF1O43189 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF1O43189 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF1O43189 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF1O43189 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF1O43189 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF1O43189 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF1O43189 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF1O43189 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF1O43189 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF1O43189 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF1O43189 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF1O43189 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF1O43189 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF1O43189 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF1O43189 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF1O43189 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF1O43189 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF1O43189 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF1O43189 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF1O43189 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF1O43189 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF1O43189 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF1O43189 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF1O43189 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF1O43189 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF1O43189 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF1O43189 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF1O43189 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF1O43189 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF1O43189 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF1O43189 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF1O43189 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF1O43189 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF1O43189 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF1O43189 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF1O43189 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF1O43189 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF1O43189 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF1O43189 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF1O43189 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF1O43189 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF1O43189 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF1O43189 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF1O43189 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF1O43189 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF1O43189 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF1O43189 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF1O43189 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF1O43189 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF1O43189 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF1O43189 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF1O43189 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF1O43189 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF1O43189 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF1O43189 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF1O43189 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF1O43189 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF1O43189 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF1O43189 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF1O43189 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF1O43189 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF1O43189 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF1O43189 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF1O43189 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF1O43189 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF1O43189 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF1O43189 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF1O43189 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF1O43189 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF1O43189 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF1O43189 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF1O43189 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF1O43189 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF1O43189 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF1O43189 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms