Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26A1O43174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26A1O43174 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYP26A1O43174 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP26A1O43174 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26A1O43174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP26A1O43174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms