Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD9O15198 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD9O15198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD9O15198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms