Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC1BO15143 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC1BO15143 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC1BO15143 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC1BO15143 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARPC1BO15143 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms