Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCF2LO15068 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCF2LO15068 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCF2LO15068 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCF2LO15068 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCF2LO15068 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCF2LO15068 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCF2LO15068 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCF2LO15068 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCF2LO15068 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCF2LO15068 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCF2LO15068 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCF2LO15068 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCF2LO15068 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCF2LO15068 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCF2LO15068 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCF2LO15068 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MCF2LO15068 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MCF2LO15068 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCF2LO15068 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms