Protein–RNA interactions for Protein: O14796

SH2D1B, SH2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D1BO14796 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D1BO14796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D1BO14796 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D1BO14796 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D1BO14796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D1BO14796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D1BO14796 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D1BO14796 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D1BO14796 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms