Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXANKO14593 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFXANKO14593 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXANKO14593 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXANKO14593 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXANKO14593 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXANKO14593 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXANKO14593 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXANKO14593 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms