Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS1O00470 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS1O00470 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEIS1O00470 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS1O00470 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS1O00470 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS1O00470 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms