Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KRW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3KRW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3KRW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3KRW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KRW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KRW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KRW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KRW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KRW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KRW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
J3KRW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
J3KRW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
J3KRW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
J3KRW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
J3KRW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
J3KRW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3KRW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3KRW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3KRW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3KRW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3KRW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
J3KRW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms