Protein–RNA interactions for Protein: H7C2G1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C2G1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H7C2G1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H7C2G1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H7C2G1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C2G1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C2G1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C2G1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C2G1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C2G1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H7C2G1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H7C2G1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H7C2G1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H7C2G1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H7C2G1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H7C2G1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H7C2G1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H7C2G1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H7C2G1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H7C2G1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H7C2G1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H7C2G1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H7C2G1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H7C2G1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H7C2G1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H7C2G1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H7C2G1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H7C2G1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H7C2G1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H7C2G1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H7C2G1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H7C2G1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H7C2G1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H7C2G1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H7C2G1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H7C2G1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H7C2G1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H7C2G1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H7C2G1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H7C2G1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H7C2G1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H7C2G1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H7C2G1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H7C2G1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H7C2G1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H7C2G1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H7C2G1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H7C2G1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H7C2G1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H7C2G1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H7C2G1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H7C2G1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H7C2G1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H7C2G1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H7C2G1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H7C2G1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H7C2G1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H7C2G1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H7C2G1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H7C2G1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H7C2G1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H7C2G1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H7C2G1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H7C2G1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H7C2G1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H7C2G1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H7C2G1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H7C2G1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H7C2G1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H7C2G1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H7C2G1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H7C2G1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H7C2G1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H7C2G1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H7C2G1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H7C2G1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H7C2G1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms