Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPA5E9PKD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPA5E9PKD4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPA5E9PKD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA5E9PKD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPA5E9PKD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA5E9PKD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms